编程开发
使用Rstudio下载GEO芯片数据
学习GEO芯片数据下载时踩了各种坑。记录如下:
跟从老师讲解,尝试使用GEOquery下载:
library('GEOquery')
library(dplyr)
library(tidyverse)
gset <- getGEO(GEO='GSE87211', destdir=".", getGPL = F)
### destdir存储目录位置,getGPL=F为拒绝下载注释文件
报错。
1.Git 安装及配置
Git 安装配置
在使用Git前我们需要先安装 Git。Git 目前支持 Linux/Unix、Solaris、Mac和 Windows 平台上运行。
Git 各平台安装包下载地址为:
Linux 平台上安装
Git 的工作需要调用 curl,zlib,openssl,expat,libiconv 等库的代码,所以需要先安装这些依赖工具。
Pyscenic 转录因子分析feather V2 问题
dbs = [RankingDatabase(fname=fname, name=name(fname)) for fname in db_fnames]
进行至这一步的时候,出现如下错误:"hg19-tss-centered-5kb-10species.mc9nr.feather" is a cisTarget Feather database in Feather v1 format, whi
JAVA解析文件内容(Apache tika)
Tika支持多种功能:文档类型检测 内容提取 元数据提取 语言检测。
文章转载——如何使用Tika提取文件内容
什么是tika
Tika全名Apache Tika,是用于文件类型检测和从各种格式的文件中提取内容的一个库。
Tika使用现有的各种文件解析器和文档类型的检测技术来检测和提取数据。
使用Tika,可以轻松提取到的不同类型的文件内容,如电子表格,文本文件,图像,PDF文件甚至多媒体输入
723 恭喜儿子面试第一
日更 723 天(2023 年 4 月 22 日 星期六 雨)
前天早上,儿子突然接到华中科技大学同济医学院的面试通知,儿子觉得不想去,我们也没有强求他,让他自己决定。
中午的时候,儿媳妇的姑妈姑爹电话说让他去面试,给自己多一个选择。
于是,他们两个临时决定去参加面试,买高铁票,买飞机票,一气呵成,运气非常好,时间都非常合适。
昨天上午,儿子微信发来消息,他面试成绩第一,远远超过第二名。
面试他们
