生信log34|dbNSFP的phyloP30_score的来源-以提取hg38_phyloP30way.bw(bigwig)数据为例
dbNSFP数据库收录了PhyloP值的数据,并且是tsv格式的,为了对一下数据库,就去官网找了相关的数据,但是看了一圈并没有现成的tsv。看了一圈资料也没看出怎么得出dbNSFP里面的phyloP这个唯一值怎么来的。后面尝试了很多,才发现原来如此简单:就是把官网上的bw文件转成 bedGraph文件即可,但是这个做法会把7.9G的数据拓展至50G左右,转换数据需慎重。
1、工具准备及其用法