编程开发

跟着Nature学作图:R语言ggplot2山脊图添加辅助线

论文 Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding #MOESM8 没有找到论文里的作图的代码,但是找到了部分组图数据,我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图 今天的推文重复一下论文中

Python基础笔记6

Python 基础语法6 字典(dict) 当需要存放键值对数据的时候,就需要用到字典。 字典和列表很相似,都由逗号做间隔,逗号间隔的叫元素。 与列表不同的是,字典每个元素由键与值组成,字典外层使用大括号{ }, 列表外层使用中括号[ ]。 fc = { '小飞': 95, '小艾':90, '乐迪':86, '酷飞':80, '安琪':80 } 字典的元素由键与值组成,组成形式 键:值,冒

从Scanpy的Anndata对象提取信息并转成Seurat对象(适用于空间组且涉及h5文件读写)2022-06-14

关键字 Anndata对象转成Seurat对象 h5文件读写 空间组格式转换 已补充快速使用的函数整理版本,如果不想看细节可以直接看已整理好的版本。 适用背景 众所周知,单细胞数据分析有两大软件:基于R语言的Seurat和基于Python的Scanpy,在平时的分析中常常需要把Seurat对象转成Scanpy的Anndata对象,这已经有比较成熟的流程了。但是,如果反过来把Anndata对象转

变大了的wx字体

前几天和同学聊天的时候,不得不聊到了一个悲催的话题:内存告急不够用…… 于是讨论着,我就我和他聊上了:如何才可以清理内存? 我一边录屏,一边翻看着我的文件管理,打开程序一个一个清理缓存,可是很明显,效果微乎其微。 我一时心急,想:为什么应用数据是不能清理的呢?我想要试一试(就很多程序数据都6个G多,太费内存了吧!) 于是我很手欠的点了个wx的数据清理,浏览器以及醒图的都把数据清理了。 因为正在和我