四步完成单细胞数据调控网络流程分析-SCENIC/pySCENIC-2022-09-06
适用背景
单细胞转录组调控网络分析是单细胞转录组分析内容的高级分析之一,本文将介绍SCENIC/pySCENIC的流程,具体原理和内容不展开,主要展示代码复现流程。R的SCENIC基于AUCell,RcisTarget和GENIE3三个包进行分析,所以要先安装这些依赖包,而pySCENIC则已经封装好,直接用pip安装即可。只用SCENIC或pySCENIC也可以单独完成分析,但R语言运行起来很慢
