人工智能

重测序分析(18)GWAS分析实操(4)gwas_tassel_mlm

混合线性模型MLM:GLM模型中,如果两个表型差异很大,但群体本身还含有其他的遗传差异(如地域等),则那些与该表型无关的遗传差异也会影响到相关性。MLM模型可以把群体结构的影响设为协方差,把这种位点校正掉。此外,材料间的公共祖先关系也会导致非连锁相关,可加入亲缘关系矩阵作为随机效应来矫正。 数据准备 表型数据:sample.table Q矩阵:snp.3.Q vcf文件:all_s

Java并发编程——CompletableFuture详解

一、简介 JDK 5引入了Future模式。Future接口是Java多线程Future模式的实现,在java.util.concurrent包中,可以来进行异步计算。 Future模式是多线程设计常用的一种设计模式。Future模式可以理解成:我有一个任务,提交给了Future,Future替我完成这个任务。期间我自己可以去做任何想做的事情。一段时间之后,我就便可以从Future那儿取出结果。

推荐系统的技术栈

推荐系统是一个非常大的框架,有非常多的模块在里面,完整的一套推荐系统体系里,不仅会涉及到推荐算法工程师、后台开发工程师、数据挖掘/分析工程师、NLP/CV工程师还有前端、客户端甚至产品、运营等支持。我们作为算法工程师,需要掌握的技术栈主要就是在算法和工程两个区域了,所以这篇文章将会分别从算法和工程两个角度出发,结合两者分析当前主流的一些推荐算法技术栈。 首先从推荐系统架构出发,一种分法是将整个推荐

基于R语言的微生物群落组成多样性分析—β多样性之PCoA分析

引言     ,即主坐标分析(Principal Coordinates Analysis),是一种用于研究样本微生物群落组成相似性或差异性的数据降维分析方法。PC1 和PC2 是两个主坐标成分,图中每个点代表一个样本,点的颜色代表样本的分组,样本间的距离越近代表微生物群落结构越相似。图中圆圈一般是置信水平为95%时的置信椭圆,用于比较组间的群落结构组成相似性。 正文 1、设置工作目录 rm(li

Node实现断点续传

断点续传,顾名思义就是文件上传/下载过程中,遇到不可抗力,比如网络中断,服务器异常,或者其他原因导致操作中断;再次操作时,可以从已经上传/下载的部分开始继续上传/下载未完成的部分,而没有必要从头开始上传/下载。 这样就避免了文件重复上传/下载,浪费服务器空间使用,节约服务器资源,而且速度更快,更高效。 断点续传-分片上传 断点续传上传将要上传的文件分成若干个分片(Part)分别上传,

里程碑 | WeDataSphere 一站式开源大数据平台套件全面升级

国家 2035 远景规划提出要加快全面数字化转型的步伐,而“大数据平台”是数字化转型的基础技术之一。对于任何企业来说,建立和维护一个大数据平台都不是一件容易的事情,而建设一个有特色的、完整易用的大数据平台,显然更是一件技术难度极高的事情。 经过七年多的探索和实践,微众银行打造了一套一站式、金融级、全连

可观测系统之构建监控系统

一套运行微服务的基础设施并部署了很多组件,这些组件组合起来为用户提供各种功能。问题来了,如何确保能够对这些组件的交互情况以及基础设施的执行情况了如指掌。当出现不符合预期的情况时,要尽可能早地知道,这是至关重要的。如何搭建一套监控系统,就可以收集相关的度量指标,观察系统的运行情况和配置相关的告警,进而才可以抢先采取行动保证系统的平稳运行。 稳固的监控技术栈可以收集来自基础设施和微服务的度量指标,并使

土壤水分特征参数估计(soil water characteristic)

引言 土壤水分特征是水文学研究的重点,在作物模型中也是计算土壤水平衡不可或缺的参数。研究中一般用水分特征曲线来反映土壤的持水特征,渗透特征曲线可以反映土壤渗透特征。 这里面有几个主要的参数 永久萎蔫点(土壤水势约为-1500kp) 最大田间持水量(土壤水势约为-33kp) 饱和含水量(土壤水势为0kp) 饱和渗透率(mm/h) 美国农业局研发的软件 soil water characteris

R语言rhdf5读写hdf5文件(.h5)并展示文件组织结构和索引数据实现

h5只是一种简单的数据组织格式【层级数据存储格式(HierarchicalDataFormat:HDF)】,该格式被设计用以存储和组织大量数据。 h5数据存储结构.jpg 在一些单细胞文献中,作者通常会将分析的数据上传到GEO数据库保存为.h5格式文件,而不是我们常见的工程文件(rds文件,表格数据等),所以为了解析利用这些数据需要对hdf5格式的组织结构有一定的了解。(注:在Se

一题说加减乘除中的凑整

          经典例题 72÷8x305-56×125+75×101         分析与解答 四则混合运算时,运算顺序应是先算乘除后算加减。因此上述算式中分三块分析: ①前一部分注意到72÷8=9,改写305=300+5; ②中间部分注意到56=7x8,和8x125=1000(这个是要记住的) ③后一部分注意到101=100+1 所以, 72÷8x305-56×125+75×101 =9