人工智能
重测序分析（18）GWAS分析实操（4）gwas_tassel_mlm
混合线性模型MLM：GLM模型中，如果两个表型差异很大，但群体本身还含有其他的遗传差异（如地域等），则那些与该表型无关的遗传差异也会影响到相关性。MLM模型可以把群体结构的影响设为协方差，把这种位点校正掉。此外，材料间的公共祖先关系也会导致非连锁相关，可加入亲缘关系矩阵作为随机效应来矫正。
数据准备
表型数据：sample.table
Q矩阵：snp.3.Q
vcf文件：all_s
R语言绘制组间比较散点图并自动添加P值信息
查询ggprism包使用时候发现官网给出的一示例图比较常用，这里记录学习一下。
image-20221208130405959
加载R包准备数据
## 加载R包
sapply(c('dplyr',"ggplot2","ggprism",
"ggbeeswarm","rstatix"), require, character.only = TRUE)
## 准备数
案例分享 | 基于Linkis+DSS构建合合信息一站式数据开发平台
目录指引
1. IDS 的简介
2. IDS 的诞生背景
3. IDS——合数据工坊的实践之路
3.1 用户权限
3.2 引擎增强
3.3 作业调度
3.4 数据治理
3.5 IDS 中一些小的功能改造点或应用项
4. 总结
5. 参考文档
1. IDS 的简介
Intsig Data Studio（IDS）是上海合合信息科技股份有限公司，大数据平台基于微众WDS社区开源的Linkis&
Seurat数据结构学习.1
Seurat.obj.v3.png
Seurat对象中的Assay:
######################################################################
在-RNA槽：
@counts:未作任何处理的原始RNA表达矩阵。
@data:原表达矩阵通过NormalizeData()归一化消除测序文库差异（对于每个细胞，将每个基因的表
DeepSeek打破AI天花板：MoE架构+RL推理，效率提升5倍的底层逻辑
文章目录
一、引言
二、MoE架构：高效计算的核心支撑
（一）MoE架构概述
（二）DeepSeek MoE架构的创新点
（三）MoE架构的代码实现示例
三、RL推理：智能提升的关键驱动
（一）RL推理概述
（二&#
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标准化
降维和聚类
检测空间差异表达基因
交互可视化
与单细胞转录组整合分析
整合切片信息
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本教程：Seurat (>=3.2)
help(Seurat)
## 安装包：
# Enter commands in R (or R studio, if i
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